يمتلك الدكتور الفاتح 30 عاماً من الخبرة الواسعة في مجالات علم الأمراض العامة، وعلم الأمراض والكيمياء، والكيمياء الحيوية السريرية، والطب المخبري، كما أنه ممارس متدرب في بريطانيا وحاصل على اعتماد المجلس الطبي، ومزود بمعرفة شاملة وتدريب قوي في مجاله، مما مكنه من التفوق في مهارات فحص وتحليل الأمراض المعقدة.
بعد حصوله على درجة الدكتوراه في الطب من السودان، تلقى الدكتور أبوبكر تدريباً متخصصاً في مستشفى جامعة برمنغهام ذي الشهرة العالمية وكينغز كوليدج لندن، حيث عمل كزميل أبحاث فخري ومسؤول أول.
بالإضافة ذلك، حصل على عضوية الكلية الملكية للأطباء الكيميائيين وزمالة الكلية الملكية العالمية لأطباء وعلماء الأمراض، وشهادة إكمال التدريب المتخصص في علم الأمراض الكيميائي من بريطانيا.
بالإضافة لدوره السريري، قام الدكتور أبوبكر في العديد من الأدوار الأكاديمية ونشر العديد من المقالات في المجلات العلمية البارزة.