يعمل الدكتور زاهر بابكر مديرا لبرنامج زمالة الأمراض المعدية ورئيسا لبرنامج الإشراف على المضادات الحيوية في مدينة الشيخ شخبوط الطبية أبو ظبي. كما يعمل الدكتور زاهر بابكر كأستاذ في كلية الطب والعلوم الصحية في جامعة خليفة في أبو ظبي. تتركز الاهتمامات البحثية للدكتور زاهر بابكر على الأمراض المعدية الناشئة والمتجددة ، طب المناطق الحارة وصحة المهاجرين ، فيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز ، إلتهاب الكبد الفيروسي ، الإلتهابات الجرثومية التى تصيب الأفراد الذين يعانون من نقص المناعة ، الإشراف على المضادات الحيوية ، و الصحة الرقمية